Publikationen

 

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Presseartikel und Mitteilungen

09.07.08 Mit GRID-Technologie schneller zum Ergebnis
In Berlin trafen sich am 2. Juli 2008 Wissenschaftler erstmalig zum Forum GRID. Sie wollen die Nutzung freier Rechnerkapazitäten an verteilten Standorten durch die Medizin- und Pharma-Forschung vorantreiben. mehr
03.07.08 Ein Kraftpaket für die Spitzenforschung Norddeutschlands
Am 3. Juli wurde der neue Hochleistungsrechner der Firma Silicon Graphics (SGI) durch die sechs Bundesländer Berlin, Bremen, Hamburg, Mecklenburg-Vorpommern, Niedersachsen und Schleswig-Holstein feierlich in Betrieb genommen. mehr
14.05.08 Göttingen erprobt Nachfolger des Internet
Artikel über die Eröffnung des Grid Ressourcenzentrum in Göttingen
23.01.08 Rechenleistung soll wie Strom aus der Steckdose fliessen
Artikel über das Grid Ressourcenzentrum in Göttingen
02.11.07 Göttinger Forscher bauen interdisziplinäres Grid-Ressourcenzentrum auf
17.09.07 Mit dem Netzwerk ändert sich das Denken
Artikel über das D-GRiD All-Hands-Meeting in Göttingen
07/2007 Geballte Rechenkraft für die Medizin
Vernetzte Computer bewältigen datenintensive Forschungsaufgaben
16.07.07 Risiko-Gen für Gallenstein entdeckt
Deutsche Forscher haben eine Gen-Mutation gefunden, die offenbar die Bildung von Gallensteinen verursachen kann. mehr
05.07.07 Computer im Verbund schaffen Op-Simulation in Minuten
Brachliegende Kapazitäten von Rechnern können auch für die Medizin genutzt werden Projekt MediGRID als Vorreiter für andere Gebiete. mehr
24.08.06 Wenn Computer gemeinsam rechnen ...
Von der Operationsplanung bis zur Jagd auf außerirdisches Leben (MBZ 12/2006, Seite 15)

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MediGRID Manuale und Richtlinien

Guidelines for the Deployment of Applications in MediGRID v1.2 (06.12.2007)
Andreas Hoheisel (Fraunhofer FIRST), Dietmar Sommerfeld (GWDG), Kathrin Peter (ZIB)

Die Richtlinie "Guidelines for the Deployment of Applications in MediGRID" beschreibt den Installationsprozess von Anwendungen auf MediGRID-Ressourcen, mit dem Ziel, die Anwendungen auf einfache Art und Weise für Endnutzer bereitzustellen. Die Zielgruppe für diese Richtlinie sind  MediGRID-Anwendungsentwickler, welche ihre domänenspezifische Software für die Verwendung im Grid anpassen und für die Grid-weite Nutzung verfügbar machen wollen. [ PDF | 1,2 MB ]

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Publikationen

  1. Andraschek M (2007). Datenmanagement- / Workflow-Integration für MediGRID, Diplomarbeit, Universität Potsdam, Institut für Informatik, 2007.
  2. Bartsch R, Kantelhardt JW, Penzel T, Havlin S (2007). Experimental evidence for phase synchronization transitions in the human cardiorespiratory system. Phys.Rev.Lett. 98(5).
  3. Beronov K, Dzhimova O, Delgado A, Vossberg M, Krefting D, et al. (2008). Virtual endovascular correction and hemodynamic analysis over the MediGRID-portal, eMBEC 2008 IFMBE Proceedings ECIFMBE 2008, 4th European Conference of the International Federation for Medical and Biological Engineering.
  4. Beronov K, Dzhimova O, Tolxdorff T, Vossberg M, Krefting D (2009). Grid computing for detailed hemodynamics-simulation-based planning of endovascular interventions Healthgrid 2009.
  5. Buch S, Schafmayer C, Völzke H, Becker C, Franke A, von Eller-Eberstein H, Kluck C, Bäßmann I, Brosch M, Lammert F, Miquel JF, Nervi F, Wittig M, Rosskopf D, Timm B, Höll C, Seeger M, ElSharawy A, Fändrich F, Fölsch UR, Krawczak M, Schreiber S, Nürnberg P, Tepel J, Hampe J (2007). A genome-wide association scan identifies the hepatic cholesterol transporter ABCG5/ABCG8 as a susceptibility factor for human gallstone disease. Nat Genet 39(8), S. 995-999.
  6. Canisius S, Mayer G, Ploch T, Koehler U, Kesper K (2007). Automatische Analyse der Muskelaktivitätt zur Untersuchung der REM-Schlaf-Verhaltensstîrung (RBD). Somnologie Suppl. 1, S. 180.
  7. Canisius S, Penzel T, Kesper K, Krefting D (2009). Application of Grid technology for automated detection of sleep disordered breathing Healthgrid 2009.
  8. Canisius S, Ploch T, Gross V, Jerrentrup A, Penzel T, et al. (2008). Detection of sleep disordered breathing by automated ECG analysis. Conf.Proc.IEEE Eng Med.Biol.Soc. 2008, S. 2602-2605.
  9. Canisius S, Ploch T, Kesper K, Smith M, Freisleben B, et al. (2007). Sleep medicine as a scenario for medical grid application. Stud.Health Technol.Inform. 126, S. 37-46.
  10. Canisius S, Viezens F, Hornung B, Ploch T, Krefting D, et al. (2008). Datenschutz für die vernetzte Phänotypisierung in der Schlafmedizin. Somnology - Sleep Research and Sleep Medicine 12(Supplement 1), S. 22-23.
  11. Dickmann F, Viezens F, Sax U (2008). Grid Computing und die Zukunft der IT im Gesundheitswesen. German Medical Science, S. 101-103.
  12. Dobrev A, Scholz S, Zegners D, Stroetmann KA, Semler SC (2009). Economic Performance and Sustainability of HealthGrids: Evidence from Two Case Studies, Healthgrid 2009. IOS Press, in press.
  13. Drepper J, Semler SC, Mohammed Y, Sax U (2006). Aktuelle Themen des Datenschutzes und der Datensicherheit in der biomedizinischen Forschung. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Voge, München, S. 25-36.
  14. El Sharawy A, Manaster C, Teuber M, Rosenstiel P, Kwiatkowski R, Huse K, Platzer M, Becker A, Nürnberg P, Schreiber S, Hampe J (2006). SNPSplicer – Systematic analysis of SNP-dependent splicing in genotyped cDNAs. Human Mutation.
  15. Falkner J, Steinke T, Weisbecker A (2006). Grid-Computing. In: Sax U, Mohammed Y Viezens F, Rienhoff, O. (Hrsg.). Grid-Computing in der biomedizinischen Forschung: Datenschutz und Datensicherheit. München: Urban und Vogel, S. 44-55.
  16. Falkner J, Weisbecker A (2006). Integration of ASlications in MediGRID In: Bubak, M., Turala, M., Wiatr, K.: Cracow 2006 Grid Workshop ProceedingS Krakow: Academic Computer Centre Cyfronet AGH, S. 511-518.
  17. Falkner J, Weisbecker A (2008). Medizin – Unterstützung von Prostatabiopsien durch Ultraschall Bildbearbeitung. In: Weisbecker A, Pfreundt, F.-J, Linden, J, Unger S (Hrsg.). Fraunhofer Enterprise Grids: Business CaseS Stuttgart: Fraunhofer IRB, S 31-33.
  18. Falkner J, Weisbecker A, Spath D (2008). Virtualisierung und Grid Computing: Aktuelle Trends und Erfahrungsberichte zum Einsatz von Virtualisierung – und Gridtechnologien. Spath, D, Weisbecker A, Falkner J (Hrsg.). (2008) Virtualisierung und Grid Computing. Stuttgart: Fraunhofer IRB, S. 1-13.
  19. Franke A, Wollstein A, Teuber M, Wittig M, Lu T, Hoffmann K, Nürnberg P, Krawczak M, Schreiber S, Hampe J (2006). GENOMIZER - An Integrated Analysis System for Genome-Wide Association Data. Human Mutation, 27(6), S. 583-588.
  20. Groß A, Hartung M, Kirsten T, Rahm E (2008). Evolution-based analysis of functional protein annotation. In: Thiery et al. (Eds.), Leipzig Research Festival for Life Sciences 2008. S. 50.
  21. Groß A, Hartung M, Kirsten T, Rahm, E (2009). Estimating the quality of ontology-based annotations by considering evolutionary changes. In: Paton et al. (Eds.), Data Integration in the Life Sciences 2009. Lecture Notes in Computer Science (LNBI). Springer, Berlin / Heidelberg 2009, To appear.
  22. Hampe J, Franke F, Rosenstiel P, Till A, Teuber M, Huse K, Albrecht M, Häsler R, Sipos B, Mayr G, De La Vega FM, Briggs J, Günther S, Prescott NJ, Onnie CM, Fölsch UR, Lengauer T, Platzer M, Mathew CG, Krawczak M, Schreiber S (2009). A genome-wide association scan of non-synonymous SNPs identifies a susceptibility variant for Crohn disease in the autophagy-related 16-like (ATG16L1) gene. Nat. Genet. in press.
  23. Hartung M (2008). Management von Ontologien in den Lebenswissenschaften. In: Höpfner, Klan (Eds.), Proceedings of the 20. GI-Workshop on Foundations of Databases (Grundlagen von Datenbanken). Technical Report 01/2008 School of Information Technology, International University in Germany 2008, S. 111-115.
  24. Hartung M, Kirsten T, Groß A, Rahm E (2008). Exploring changes in life science ontologies with OnEX. In: Thiery et al. (Eds.), Leipzig Research Festival for Life Sciences 2008. S. 49.
  25. Hartung M, Kirsten T, Groß A, Rahm E (2009). OnEX: Exploring Changes in Life Science Ontologies. Submitted to BMC Bioinformatics (in review).
  26. Hartung M, Kirsten T, Rahm E (2008). Analyzing the Evolution of Life Science Ontologies and Mappings. In: Bairoch et al. (Eds.), Data Integration in the Life Sciences 2008. Lecture Notes in Computer Science (LNBI) 5109. Springer, Berlin / Heidelberg 2008, S. 11-27.
  27. Hartung M, Loebe F, Herre H, Rahm E (2008). A platform for collaborative management of semantic grid metadata. In: Badica et al. (Eds.), Intelligent Distributed Computing Systems & Applications. Studies in Computational Intelligence 162. Springer, Berlin / Heidelberg 2008, S. 115-125.
  28. Hartung M, Loebe F, Herre H, Rahm E (2009). Management of Evolving Semantic Grid Metadata Within a Collaborative Platform. Submitted to Information Sciences – Special Issue on "Intelligent Distributed Information Systems" (in review).
  29. Hartung M, Rahm E (2007). A Grid Middleware for Ontology Access. In: Proc. 1st German eScience Conference (GES). Conference Paper, ID:  315463.0, Max Planck Digital Library, 2007.
  30. Henschel A, Kim WK, Schroeder M (2006). Equivalent binding sites reveal convergently evolved interaction motifs. In Bioinformatics, 22(5), S. 550-556.
  31. Hoheisel A (2008). Grid-Workflow-Management. In: Weisbecker A, Pfreundt, F.-J, Linden, J, Unger S (Hrsg.). Fraunhofer Enterprise Grids - Software. Fraunhofer IRB Verlag, Stuttgart.
  32. Hoheisel A (2008). Yagsi - Sicherheitsinfrastruktur für serviceorientierte Architekturen. In: Weisbecker A, Pfreundt, F.-J, Linden, J, Unger S (Hrsg.). Fraunhofer Enterprise Grids - Software. Fraunhofer IRB Verlag, Stuttgart.
  33. Hoheisel A, Sommerfeld, D, Peter K (2008). Guidelines for the Deployment of ASlications in MediGRID Technical report, MediGRID, 2008..
  34. Hoheisel A, Unger S (2008). Pharma - Screening Anwendung aus dem Drug-Design. In: Weisbecker A, Pfreundt, F.-J, Linden, J, Unger S (Hrsg.). Fraunhofer Enterprise Grids: Business CaseS Stuttgart: Fraunhofer IRB Verlag, S. 34-35.
  35. Huang B und Schroeder M (2006). LIGSITEcsc: predicting ligund binding sites using the Connolly surface und degree of conservation. BMC Structural Biology.
  36. Kesper K, Canisius S, Jerrentrup A, Penzel T, Koehler U (2007). Entwicklung einer computergestützten EKG-Analyse zur Bestimmung respiratorischer Parameter. Somnologie Suppl. 1.
  37. Kim WK, Henschel A, Winter C, Schroeder M (2006). The many faces of protein-protein interactions: A compendium of interface geometry. In Plos Computational Biology.
  38. Kirsten T, Rahm E (2006). BioFuice: Mapping-based data integration in bioinformatics. In: Leser et al. (Eds.), Data Integration in the Life Sciences 2006. Lecture Notes in Computer Science (LNBI) 4075. Springer 2006, S. 124-135.
  39. Kirsten T, Thor A, Rahm E (2007). Instance-based matching of large life science ontologies. In: Cohen-Boulakia, Tannen (Eds.), Data Integration in the Life Sciences 2007. Lecture Notes in Computer Science (LNBI) 4544. Springer 2007, S. 172-187.
  40. Kottha S, Peter K, Steinke Th, Bart J, Falkner J, Weisbecker A, Viezens F, Mohammed Y, Sax U, Hoheisel A, Ernst T, Sommerfeld D, Krefting D, Vossberg M (2007). Medical Image Processing in MediGRID. German eScience Conference (GES 2007), Baden-Baden, Online: http://edoc.mpg.de/display.epl?mode=doc&id=316613&col=100&grp=1414.
  41. Kottha S., Abhinav K., Müller-Pfefferkorn R., Mix H (2007). Accessing Bio-Databases with OGSA-DAI - A Performance Analysis. In: LNCS Vol. 4360: Proceedings of Distributed, High-Performance and Grid Computing in Computational Biology - International Workshop GCCB 2007, S 141-156, Springer, 2007.
  42. Krawczak M, Thomas NST, Hundrieser B, Mort M, Wittig M, Hampe J, Cooper DN (2006). Single Base-Pair Substitutions in Exon–Intron Junctions of Human Genes: Nature, Distribution, und Consequences for mRNA Splicing. Human Mutation.
  43. Krefting D, Bart J, Beronov K, Dzhimova O, Falkner J, Hartung M, Hoheisel A, Knoch T, Lingner T, Mohammed Y, Peter K, Rahm E, Rienhof O, Sax U, Sommerfeld D, Steinke T, Tolxdorff T, Vossberg M, Viezens F, Weisbecker A (2009). MediGRID: Towards a user friendly secured grid infrastructure. Future Generation Computer Systems, 25(3), S. 326-336.
  44. Krefting D, Canisius S, Hoheisel A, Tolxdorff T, Penzel T (2009). Gridbased Sleep Research - Analysis of Polysomnographies using a Grid Infrastructure 9th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, Shanghai.
  45. Krefting D, Canisius S, Penzel T (2008). Automatisierte Signalanalyse von Polysomnographien unter Verwendung eines Griddatenmanagementsystems 16. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Schlafforschung und Schlafmedizin.
  46. Krefting D, Canisius S, Peter K, Tolxdorff T, Penzel T (2008). Signalanalyse von Polysomnographien unter Verwendung einer Gridinfrastruktur 53. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (gmds), Stuttgart.
  47. Krefting D, Falkner J, Hoheisel A, Weisbecker A et al. (2008). MediGRID: Towards a user friendly secured grid infrastructure, Future Generation Computer Systems 25(3), March 2009, S. 326-336.
  48. Krefting D, Vossberg M, Beronov K, Tolxdorff T (2008). Standortunabhängiger Zugang und interaktive Steuerung von gridbasierten Diensten zur medizinischen Bildverarbeutung über ein Gridportal 53. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (gmds).
  49. Krefting D, Vossberg M, Tolxdorff T (2008). Medizinische Bildverarbeitung im MediGRID Poster Presentation, 22. Treffpunkt Medizintechnik, Berlin, Charité - Universitätsmedizin Berlin, Campus Virchow, Berlin.
  50. Krefting D, Vossberg M, Tolxdorff T (2008). Simplified Grid Implementation of Medical Image Processing Algorithms using a Workflow Managment System. Proc. of the Workshop on Medical Imaging on Grids (MICCAI-Grid), S. 23-32.
  51. Krefting D, Vossberg, M, Hoheisel A, Tolxdorff T (2008). Simplified Grid Implementation of Medical Image Processing Algorithms using a Workflow Management System. In: Future Generation Computer Systems, Elsevier (submitted).
  52. Legré Y, Mohammed Y, Viezens F, Rienhoff O, Sax U (2008). HealthGRID/ SHARE: Grids for Health - International Interoperability eHealth Conference 2007 - Experts' Special Interest Sessions. nanos Verlag oHG, Bonn, S. 81-99.
  53. Lingner T und Meinicke P (2006). Remote homology detection based on oligomer distances. Bioinformatics 22, S. 2224-2231.
  54. Luchtmann M, Baecke S, Bernarding J (2007). Neuroimaging: SPM als verteilte Komponente in Grid- und Cluster-Architekturen BVM2007 - Bildverarbeitung für die Medizin.
  55. Luchtmann M, Baecke S, Lätzkendorf R, Bernarding J (2007). MediGRID: Distributed Computing to Accelerate fMRI Analysis 52. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (gmds).
  56. Lützkendorf R, Bernarding J, Hertel F, Viezens F, Thiel A, et al. (2009). Enabling of Grid based Diffusion Tensor Imaging Using a Workflow Implementation of FSL Healthgrid 2009, Berlin.
  57. Manaster C, Zheng W, Teuber M, Wächter S, Döring F, Schreiber S, Hampe J (2005). InSNP – a tool for automated detection und visualization of SNPs und InDels, Human Mutation 26, S. 1-9.
  58. May P, Ehrlich HC, Steinke Th (2006). ZIB Structure Prediction Pipeline: Composing a Complex Biological Workflow through Web Services. In: Nagel et al. (Eds.), Euro-Par 2006 Parallel Processing. Lecture Notes in Computer Science. Springer, Berlin u.a., S. 1148-1158.
  59. Mayer G, Kesper K, Ploch T, Canisius S, Penzel T, et al. (2008). Quantification of tonic and phasic muscle activity in REM sleep behavior disorder. J.Clin.Neurophysiol. 25(1), S. 48-55.
  60. Meinicke P, T. Brodag, Fricke WF, Waack S (2006). P-value based visualization of codon usage data. Algorithms for Molecular Biology1,10.
  61. Merelli E et al. (2006). Agents in bioinformatics, computational und systems biology. Briefings in Bioinformatics.
  62. Mohammed Y (2006). Erweiterte Sicherheit und Datenschutz Techniken. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München, S. 70-77.
  63. Mohammed Y, Rey S, Rakebrandt F, Sax U (2007). The Integration of Grid Resources into a Portal for Research Collaboratories. Stud Health Technol Inform 129, S. 335-339.
  64. Mohammed Y, Sax U, Viezens F, Rienhoff O (2007). Shortcomings of Current Grid Middlewares Regarding Privacy in HealthGrids. Stud Health Technol Inform 126, S. 322-329.
  65. Mohammed Y, Viezens, F., Sax, U., Rienhoff, O. (2006). Rechtliche Aspekte bei Grid-Computing in der Medizin. In: Niederlag W, Dierks C, et al., (Eds.) Rechtliche Aspekte der Telemedizin, Dresden, S. 235-245.
  66. Mohammed Y, Viezens, F., Sax, U.. (2006). Privacy in Grid Computing Projects for Biomedicine – The MediGRID Project. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der biomedizinischen Forschung - Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München, S. 9-15.
  67. Morgenstern B, Prohaska SJ, Pöhler D, Stadler PF (2006). Multiple sequence alignment with user-defined anchor points. Algorithms for Molecular Biology 1(1), S. 6.
  68. Müller S (2007). Realisierung von freingranularem Rechtemanagement in einer service-orientierten Grid-Architektur. Diplomarbeit, Universität Potsdam, Institut für Informatik, 2007.
  69. Olabarriaga SD, Glatard T, Hoheisel A, Nederveen AJ, Krefting D (2009). Crossing HealthGrids Borders: Early Results in Medical Imaging. Proceedings of the HealthGrid 2009, Berlin (submitted).
  70. Pellegrini, S, Hoheisel A, Giacomini F, Ghiselli A (2008). Using GWorkflowDL for Middleware-Independent Modeling and Enactment of WorkflowS In: Proceedings of the CoreGRID Integration Workshop 2008, Crete, Greece, 2008.
  71. Penzel T, Hirshkowitz M, Harsh J, Chervin RD, Butkov N, et al. (2007). Digital analysis and technical specifications. J.Clin.Sleep Med. 3(2), S. 109-120.
  72. Peter K (2007). Erasure-tolerant Codes for Rule-based Grid Storage Systems. In: 1st Baltic Conference on Advanced Topics of Telecommunications. Oktober, 2007
  73. Plantikow S, Peter K, Högqvist M, Grimme C, Papaspyrou A (2009). Generalizing the Data Management of Three Community Grids. Future Generation Computer Systems 25 (2009), S. 281-289.
  74. Platzer M, Hiller M, Szafranskzy K, Jahn N, Hampe J, Schreiber S, Backofen R, Huse K (2006). Splice acceptor SNPs - no hypervariability but sequencing errors. Nat. Biotechnology. 24(9), S. 1068-70.
  75. Pommerening K, Sax U, Müller T, Speer R, Ganslandt T, et al. (2008). Integrating eHealth and Medical Research: The TMF Data Protection Scheme. In: Blobel B, Pharow P, et al., (Eds.) eHealth: Combining Health Telematics, Telemedicine Biomedical Engineering and Bioinformatics to the Edge. Akademische Verlagsgesellschaft Aka GmbH, Berlin, S. 5-10.
  76. Rienhoff O (2006). Lösungen für sichere Grid-Anwendungen in der medizinischen Forschung. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München, S. 86-90.
  77. Rienhoff O, Kleinoeder T, Lorberg K (2006). Archivierung von Telemedizin-Sessionen. In: Niederlag W, Dierks C, et al., (Eds.) Rechtliche Aspekte der Telemedizin, Dresden, S. 219-225.
  78. Royer L, Linse B, Wachter T, Bry F, Schroeder M (2006). Querying the semantic web: A case study. In Christopher Baker und Kei-Hoi Cheung, editors, Semantic Web: Revolutionizing Knowledge Discovery in the Life Sciences. Springer.
  79. Sax U (2006). Stand der generischen Datenschutz-Konzepte sowie deren technischen Realisierung in biomedizinischen Grids. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München, S. 38-43.
  80. Sax U, Beckmann M, Müller S, Rienhoff O (2006). Von der Forschung in die Versorgung - Eine Lösung für das Kompetenznetz Angeborene Herzfehler. In: Tolxdorff T, Steyer G, (Eds.), Telemed. Akademische Verlagsgesellschaft Aka GmbH, Berlin, Berlin, 84-88. Online.
  81. Sax U, Mohammed Y, Viezens F, Rienhoff O (2006). Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München.
  82. Sax U, Schmidt S (2005). Integration of genomic data in Electronic Health Records--opportunities and dilemmas. Methods Inf Med 44(4), S. 546-550.
  83. Sax U, Weisbecker A, Falkner J, Viezens F, Mohammed Y, et al. (2007). Auf dem Weg zur individualisierten Medizin - Grid-basierte Services für die Elektronische Patientenakte der Zukunft. In: Jäckel A, (Ed.) Telemedizinführer Deutschland 2008, Ausgabe 2008 ed. Medizin Forum AG, Bad Nauheim, S. 47-51.
  84. Sax U, Weisbecker A, Falkner J, Viezens F, Mohammed Y, Hartung M, Bart J, Krefting D, Knoch, TA, Semler, SC (2007). Grid-basierte Services für die elektronische Patientenakte der Zukunft, E-HEALTH-COM 2007(4), KomPart Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG, S. 61-63.
  85. Sax U., Weisbecker A, Falkner J, Viezens F, Mohammed Y, Hartung M., Bart J, Krefting D, Knoch, T., Semler SC. (2007). Auf dem Weg zur individualisierten Medizin - Grid-basierte Services für die EPA der Zukunft. Telemed 2007, Berlin. Ausgezeichnet als bester wissenschaftlicher Beitrag.
  86. Schroeder M, Burger A, Kostkova P, Stevens R, Habermann B, Dieng-Kuntz R (2006). Sealife: A Semantic Grid Browser for the Life Sciences Applied to the Study of Infectious Diseases. Proceedings of HealthGrid 2006, Stud Health 120, S. 167-78.
  87. Scholz S, Breitner MH, Blaurock M (2008). A Sustainable Business Model Approach for Grid Computing – And a Life Sciences Example. In: Bichler M, Hess T, et al., (Eds.) Multikonferenz Wirtschaftsinformatik 2008. GITO-Verlag, Berlin, Volltext auf CD, S. 1-12.
  88. Scholz S, Breitner MH, Semler SC, Blaurock M (2007). Business Models for Grid Computing in Life Science: An Approach to Identifying Health Grid Revenue, Mednet 2007, Leipzig. Online: http://www.mednet2007.com/pdfs/fullpaper/0708MednetProceedingTMFUniHan.pdf.
  89. Scholz S, Semler SC, Breitner MH (2009). Business Aspects and Sustainability for Healthgrids – an Expert Survey Healthgrid 2009. IOS Press, in press.
  90. Schultz AK, Zhang M, Leitner T, Kuiken C, Korber B, Morgenstern B, Stanke M (2006). A jumping profile Hidden Markov Model und applications to recombination sites in HIV und HCV genomes. BMC Bioinformatics 7, S. 265.
  91. Schulz M (2007). Realisierung fehlertoleranter Workflows in einer Service-orientierten Grid-Architektur. Diplomarbeit, Universität Potsdam, Institut für Informatik, 2007.
  92. Sommerfeld D, Lingner T, Heilgeist J, Richter H (2008). Gridification and virtualization: enabling e-Science in the life sciences; MG '08: Proceedings of the 15th ACM Mardi Gras conference, Baton Rouge, Louisiana, 2008, S. 1.
  93. Sommerfeld D, Lingner T, Richter H (2007). Stepwise Enabling of AUGUSTUS for MediGRID. Technischer Report TU Clausthal, IfI-07-12 (2007), ISSN 1860-8477, http://www.in.tu-clausthal.de/fileadmin/homes/techreports/ifi0712sommerfeld.pdf.
  94. Sommerfeld D, Lingner T, Stanke M, Morgenstern B, Richter H (2007). AUGUSTUS at MediGRID: Adaption of a Bioinformatics Application to Grid Computing for Efficient Genome Analysis. Future Generation Computer Systems, 25 (2009), S. 337 – 345.
  95. Sommerfeld D, Richter H (2009). A two-tier approach to efficient workflow scheduling in MediGRID. Grid-Technologie in Göttingen - Beiträge zum Grid-Ressourcen-Zentrum GoeGrid, GWDG-Bericht Nr. 74 (2009), ISSN 0176-2516, S. 39-51.
  96. Spath, D, Weisbecker A, Falkner J (Hrsg.) (2008). Virtualisierung und Grid Computing. Stuttgart: Fraunhofer IRB Verlag.
  97. Spath, D, Weisbecker A, Höß, O (Hrsg.) (2006). IT-Virtualisierung und Grid-Computing. Tagungsband Stuttgarter Softwaretechnik Forum 2006. Stuttgart: Fraunhofer IRB Verlag.
  98. Stanke M, Keller O, Gunduz I, Hayes A, Waack S, Morgenstern B (2006). AUGUSTUS: ab initio prediction of alternative transcripts. Nucleic Acids Res.34, S. 435-439.
  99. Tech M, Morgenstern B, Meinicke P (2006). TICO: a tool for postprocessing the predictions of prokaryotic translation initiation sites. Nucleic Acids Res.34, S. 588-590.
  100. Teyra J, Doms A, Schroeder M, Pisabarro M (2006). SCOWLP: a web-based database afr detailed characterization und visualization of protien interfaces. In BMC Bioinformatics.
  101. Thor A, Hartung M, Groß A, Kirsten T, Rahm E (2009). An Evolution-based Approach for Assessing Ontology Mappings - A Case Study in the Life Sciences. In: Freytag et al. (Eds.), BTW 2009: Datenbanksysteme in Business, Technologie und Web. GI-Edition - Lecture Notes in Informatics (LNI) 144. Bonner Köllen Verlag 2009, S. 277-286.
  102. Tolosana-Calasanz R, Bañares JA, Rana OF, Álvarez P, Ezpeleta J, Hoheisel A (2008). Adaptive Exception Handling for Scientific WorkflowS Concurrency and Computation: Practice and Experience, Wiley (submitted).
  103. Viezens F (2006). Grid-Computing in der Biomedizin. In: Sax U, Mohammed Y, et al., (Eds.) Grid-Computing in der Biomedizinischen Forschung – Datenschutz und Datensicherheit. Urban&Vogel, München, S. 56-62.
  104. Viezens F, Lorberg K, Barz A, Dickmann F, Sax U (2008). Integration und Verarbeitung von Patientendaten aus Krankenhausinformationssystemen im Kontext interdisziplinärer Forschung unter Nutzung von Grid-Technologie. German Medical Science, S. 643-646.
  105. Viezens F, Sax U (2008). Collaboration at the Transition of Personalized Medicine, Electronic Health Record and HealthGRIDs – GRID Services and Applications for the Future. In: Blobel B, Pharow P, et al., (Eds.) eHealth: Combining Health Telematics, Telemedicine Biomedical Engineering and Bioinformatics to the Edge. Akademische Verlagsgesellschaft Aka GmbH, Berlin, S. 49-57.
  106. Vossberg M, Hoheisel A, Tolxdorff T, Krefting D (2008). A Reliable DICOM Transfer Grid Service Based on Petri Net Workflows, CCGRID, 441-448. Online: http://doi.ieeecomputersociety.org/10.1109/CCGRID.2008.122.
  107. Vossberg M, Krefting D, Tolxdorff T (2007). Gridcomputing in der medizinischen Bildverarbeitung: Das MediGRID Projekt BVM2007 - Bildverarbeitung für die Medizin, S. 429-433.
  108. Vossberg M, Krefting D, Tolxdorff T (2007). Using DICOM in Medical Grids. Secure Image Communication and Integration of External DICOM Devices in Globus Grids Proceedings of 5th IASTED BIOMED.
  109. Vossberg M, Tolxdorff T, Krefting D (2008). DICOM image communication in globus-based medical grids. IEEE Trans. Inf. Technol. Biomed. 12, S. 145-153.
  110. Vossberg, M, Hoheisel A, Tolxdorff T, Krefting D (2008). A Workflow-based ASroach for Fault-tolerant Medical Image Transfer in Health GridS In: Future Generation Computer Systems, Elsevier (submitted).
  111. Vossberg, M., Hoheisel A, Tolxdorff, T., Krefting D (2008). A Reliable DICOM Transfer Grid Service Based on Petri Net Workflows In: ccgrid, S. 441-448, 2008 Eigth IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid (ccgrid), 2008.
  112. Weisbecker A (2006). Grid Computing für Medizin und Lebenswissenschaften. Erscheint in: Wegweiser (Hrsg.). Jahrbuch eHealth & Gesundheitswirtschaft 2006/2007: Modernisierung, Prozessoptimierung und Vernetzung im deutschen Gesundheitswesen.
  113. Weisbecker A (2008). SaaS & Web 2.0 – Aktuelle Trends und Potenziale für Unternehmen. In: Spath, D, Weisbecker A, Höß, O. (Hrsg.). SaaS und Web 2.0. Tagungsband Stuttgarter Softwaretechnik Forum 2008. Stuttgart: Fraunhofer IRB Verlag, S. 15-33.
  114. Weisbecker A, Bart J, Falkner J (2007). MediGRID – Grid Computing for cooperative work in e-health. In: Elsner, C., Häckl, D, van der Slikke, H., Della Mea, V., Arveanitis, T.N., Wiemeth, H. (EdS). Technology and Health Care. International Journal of Health Care Engineering, Volume 15, Number 5, 2007, S. 369-370. Amsterdam: IOS press.
  115. Weisbecker A, Falkner J (2007). Benutzerfreundliche und sichere Zugänge zu Grid Ressourcen. 21. DFN-Arbeitstagung, 30.06.-01.07.2007, Kaiserslautern.
  116. Weisbecker A, Falkner J, (2009). Secure Grid Services for Cooperative Work in Medicine and Life Science. To aSear in: Lin, SC., Yen, E. (EdS). Grid Computing – International Symposium on Grid Computing (ISGC 2008). New York: Springer.
  117. Weisbecker A, Falkner J, Bart J (2006). Vom Internet zum Utility Computing – durch die optimierte Nutzung von Unternehmensressourcen zur vernetzten Arbeitswelt der Zukunft. In: Spath, D: Technologiemanagement in der PraxiS Fraunhofer IRB, S. 179-184.
  118. Weisbecker A, Falkner J, Höß, O, Spath, D (2006). IT-Virtualisierung und Grid-Computing. In: Spath, D, Weisbecker A, Höß, O. (Hrsg.). IT-Virtualisierung und Grid-Computing. Tagungsband Stuttgarter Softwaretechnik Forum 2006. Stuttgart: Fraunhofer IRB, S 3-6.
  119. Weisbecker A, Falkner J, Rienhoff O (2008). MediGRID – Grid Computing For Medicine and Life ScienceS In: Lin, SC., Yen, E. (EdS). Grid Computing – International Symposium on Grid Computing (ISGC 2007). New York: Springer, S. 57-65.
  120. Wieczorek M, Hoheisel A, Prodan R (2008). Towards a General Model of the Multi-criteria Workflow Scheduling on the GriD In: Future Generation Computer Systems, Elsevier (accepted).
  121. Winter C, Henschel A, Kim WK, Schroeder M (2006). SCOPPI: a structural classification of protein-protein interfaces. Nucleic Acid Research, 34(Database issue), S. 310-314.
  122. Zhang M, Schultz AK, Calef C, Kuiken C, Leitner T, Korber B, Morgenstern B, Stanke M (2006). jpHMM at GOBICS: a web server to detect genomic recombinations in HIV-1. Nucleic Acids Res. 34, S. 463-465.

 

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